漢及魏晉南北朝是中醫學發展蓬勃，湧現多位重要醫家，包括張仲景、華佗、王叔和、葛洪、陶弘景和皇甫謐，共築中醫學理論與臨床基礎。

張仲景

張仲景，名機，東漢末年南陽郡人，所著的《傷寒雜病論》被後世分成《傷寒論》與《金匱要略》兩書分別流通。該書系統論述外感熱病與內傷雜病，確立理法方藥治療原則。《傷寒論》帶出包括太陽、陽明、少陽、太陰、少陰和厥陰的六經辨證體系，以經絡及臟腑為基礎，將外感病分為六個階段，闡明病位深淺與傳變規律，奠定中醫辨證論治的核心框架。《傷寒論》涵蓋多條沿用至今的經典方劑，其中桂枝湯配伍嚴謹，發中有補，散中有收，組成包括桂枝、芍藥、甘草、生薑及大棗。諸藥合用，調陰陽和營衛，無論外感病或雜病均可加減使用。其加減化裁衍生數十方，展現經方配伍精髓。《傷寒論 • 辨太陽病脈證並治法上》提到「觀其脈證，知犯何逆，隨證治之」，首次提出中醫治法概念，並涵蓋多種治法，例如麻黃湯的汗法、瓜蒂散的吐法、大承氣湯的下法、小柴胡湯的和法、四逆湯的溫法、白虎湯的清法和五苓散的消法。惟《傷寒論》未就中醫治法作歸納，至後來清代《醫學心悟》才系統分為「治療八法」。

華佗

華佗，字元化，名旉，東漢末年沛國譙縣人，被稱為「外科鼻祖」。《後漢書》記載華佗「刳破腹背，抽割積聚」，開創清創術、腸吻合術等，並首次提到「針藥不及，乃刳割之」的手術準則。惟因歷史條件限制，其開腹術未能完整傳承。華佗創制世界最早的麻醉藥「麻沸散」，相傳內含曼陀羅，使患者「醉無所覺」並成功實施腹部手術。雖然麻沸散的組成失傳，但啟發了後世對麻醉藥的研究。華佗模仿虎、鹿、熊、猿、鳥創編導引養生術「五禽戲」，強調「動搖則穀氣消」，為現存最早醫療體操，列入國家級非物質文化遺産之一，現代證實具康復養生功效。

王叔和

王叔和，名熙，西晉高平人，其編纂的《脈經》正式將脈象分類為24種，並具體描述每種脈象在指下的感覺。《脈經》亦規定診脈部位在寸口，體現《難經》所講的「獨取寸口」，並將寸口分為寸、關、尺三部，進而提出左、右手的寸、關、尺與臟腑的聯繫。

葛洪

葛洪，字稚川，號抱樸子，晉朝丹陽句容人。其著作《肘後備急方》為首部中醫臨床急救手冊，書名「肘後」意指可隨身攜帶，內容收錄大量簡、便、廉、驗的急症療法，如「殺所咬犬取腦敷之」的狂犬病防治及天花的記載「比歲有病時行，乃發瘡頭面及身」等。《肘後備急方 • 卷三》記載「青蒿一握，以水二升漬，絞取汁，盡服之」治療瘧疾的方法，為全球最早的青蒿抗瘧文獻。葛洪記載的關鍵在於「絞汁」而非「煎煮」，符合現代科學中高溫煎煮會破壞有效成分的認知。2015年諾貝爾獎得主屠呦呦亦受此啟發，利用乙醚低溫提取青蒿素，彰顯傳統醫學經驗的科學價值。

陶弘景

陶弘景，字通明，南朝丹陽秣陵人，其著作《本草經集注》整合《神農本草經》與漢魏醫家用藥經驗，完善「四氣五味」的理論，並系統註釋並增補藥物至730種。《本草經集注》承先啟後，為後來唐代第一本部由國家機關頒布的藥學專著《新修本草》奠基。《本草經集注》突破《神農本草經》的「三品分類」，按米食、玉石、蟲獸、草木、菜、果的自然屬性分類藥物，並按臨床效用細分如解毒藥、風濕藥等。《本草經集注》亦首載藥物產地及採製時節等道地用藥概念。

皇甫謐

皇甫謐，字士安，西晉安定朝那縣人，融合《黃帝內經》、《針經》精華而編撰《針灸甲乙經》，首創按部位、分部記述穴位，明確針刺深度與灸療壯數，並確立349個穴位，推動針灸從經驗上升為系統理論。