《黃帝內經》、《難經》及《神農本草經》成書於秦漢時期，是重要的醫學著作，奠定了中醫藥學的理論基石。三者共同建構中醫藥學體系，至今仍是核心經典。

《黃帝內經》

《黃帝內經》分為《素問》和《靈樞》兩部分，篇章多以黃帝與精通醫術的岐伯所進行的問答展開，通過一問一答的方式闡述多個中醫核心理論。《素問 • 陰陽應象大論》提出「陰陽者，天地之道也」，將陰陽視為生命活動的根本法則。生理上「陰平陽秘」則健康，病理上「陰陽失調」則病。診治強調「察色按脈，先別陰陽」，確立中醫辨證論治的核心框架，指導臨床補瀉調和。《素問 • 陰陽應象大論》以五行闡明臟腑間生剋制化關係。肝、心、脾、肺、腎分屬五行，生理上相生相剋，病理上相乘相侮。五行應用於診斷如面色和脈象、治療如「虛則補母，實則瀉子」，形成臟腑辨證體系。《靈樞 • 經脈》詳述十二經脈循行路線，內連臟腑，外絡肢節，以運行氣血。經脈失調則相應部位病變，如「肺手太陰之脈」病見咳喘。針灸治療依經取穴，調氣導血，奠定經絡學說臨床應用基礎。《素問 • 五藏別論》以「藏精氣而不瀉」定義五臟，「傳化物而不藏」區分六腑。臟腑各司其職，如肝主疏泄、胃主受納；而病理上相互影響，如肝火犯肺。診治多以五臟對應五行進行整體調節（例如滋水涵木，即透過滋養腎以養肝），構建中醫藏象學說核心。《素問 • 至真要大論》提出「風、寒、暑、濕、燥、火」為外感病因。風性開泄，寒主收引，暑多挾濕，濕性黏滯，燥易傷津，火性炎上。六淫可單獨或兼夾致病，與體質、環境相關，導致外感病或誘發內傷雜病。

《難經》

部分古代醫家認為《難經》是戰國時期的名醫扁鵲所撰。《難經》補《黃帝內經》經絡理論之未備，當中記載：「奇經八脈者，不拘於十二經。」奇經八脈縱橫交錯於十二經脈之間，具有加強經脈間聯繫、調節經脈氣血的作用。《難經 • 一難》首次提出「獨取寸口」脈診法，謂「寸口者，脈之大會」。寸口脈象確立脈診標準化定位，寸、關、尺反映五臟六腑之氣，並可從脈象浮沉變化得知病情輕重。而扁鵲重視切脈，《難經》多篇討論脈學的內容與其醫學專長相符。《難經 • 三十六難》提出「腎兩者，非皆腎也，左為腎，右為命門」。命門為「諸神精之所舍，原氣之所繫」，病理見「男子藏精，女子繫胞」失常，強調腎的多樣化功能及其在人體的重要性。

《神農本草經》

《神農本草經》是中國最早的藥物學經典，系統記載365種藥物。其首創藥物的上、中、下三品分類，「上藥一百二十種為君，主養命以應天」，「中藥一百二十種為臣，主養性以應人」，而「下藥一百二十五種為佐使，主治病以應地」。上品久服無毒可延年，中品調理虛實需斟酌，下品攻邪治病不可久服。此分類確立中藥應用層級，為後世藥物毒性分級奠定基礎。《神農本草經》記載藥物的四氣（溫、熱、寒、涼）及五味（酸、苦、甘、辛、鹹）， 例如薏苡仁味甘微寒，四氣調陰陽，五味入五臟。臨床寒者熱之，熱者寒之，辛散、甘補、酸收、苦降、鹹軟。藥性與藥味相合，共同發揮治療作用，調和人體氣血陰陽。